近年来，医院科研水平稳步提升。现有四川省高等学校重点实验室1个、南充市重点实验室2个，正在建设四川省乙级重点实验室1个。并先后承担了国家自然科学基金、省科技厅等各级各类科研课题500余项，获省市级级成果奖20余项，全院职工发表学术论文4400余篇，其中SCI收录论文161篇。医院公开出版刊物《西部医学》为在国内外公开发行的一份综合性医学学术期刊，科技部中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊。1997年与川北医学院签订建立教学医院关系的协议，2005年正式挂牌成为川北医学院第二临床医学院，承担川北医学院的理论教学任务10余年，现年均承担理论教学3000余课时，见习带教9000余课时，临床实践教学任务20余年，现年均接收实习学生260余人。

医院1994年与西南医科大学（原泸州医学院）签订协议，正式成为“泸州医学院南充口腔教学医院”，2017年，重新挂牌“西南医科大学教学医院”，现目前，承担着包括临床本科、临床定向、预防、影像、护理等多个专业的实习任务，年均接收实习学生50人左右。

同时，医院还与重庆医科大学、雅安职业技术学院、四川康复职业技术学院、南充卫校等多所高校建立了教学关系，承担其实践教学任务。